- Podkreślić przy tym należy, że na równi z zaległością podatku traktuje się również zwróconą lub zaliczoną na poczet zaległości z innych tytułów, nadpłatę wynikającą ze złożonej deklaracji lub zeznania podatkowego, a także nienależnie otrzymany zwrot podatku chyba, że otrzymany zwrot nie wynikał z winy podatnika. Powstanie zaległości podatkowej rodzi obowiązek zapłaty odsetek. Odsetki od zaległości podatkowych – od 26.03.2009 –w wysokości 10,5% rocznie obciążają przy tym zarówno samego podatnika jak również płatnika, inkasenta ich następców prawnych jak i w pewnych wypadkach osoby trzecie – w zakresie w jakim odpowiadają oni za zobowiązania podatników, płatników lub inkasentów - mówi Mirosław Michna.

Odsetki za zwłokę biegną od dnia następującego po upływie terminu płatności podatku przez podatnika, płatnika lub inkasenta lub od dnia otrzymania przez te osoby nienależnej nadpłaty lub zwrotu podatku. - Konsekwencją uznania za zaległość podatkową niewpłaconych w terminie zaliczek na podatek dochodowy jest wynikająca z przepisów Ordynacji podatkowej konieczność naliczenia odsetek za zwłokę z tytułu zaliczek na podatek niewpłaconych w trakcie roku podatkowego. Po zakończeniu roku podatkowego w przypadku stwierdzenia przez organ podatkowy niezłożenia deklaracji lub niezapłacenia zaliczek na podatek dochodowy lub też wpłacenia ich w wysokości niższej niż należna, odsetki są liczone od dnia następującego po terminie powstania zaległości do dnia złożenia zeznania podatkowego lub też na ostatni dzień terminu, w którym powinno nastąpić złożenie zeznania podatkowego. Następnie, jeżeli z rozliczenia za cały rok nadal będzie wynikać zaległość podatkowa – odsetki naliczane będą od tej zaległości - uważa Michna.

Ordynacja podatkowa zawiera przy tym ograniczenia w okresie naliczania odsetek za zwłokę jeśli opóźnienie w płatności wynika z działania organu podatkowego. W szczególności, nie są naliczane odsetki za zwłokę za okres po upływie terminu do wydania decyzji w postępowaniu odwoławczym do dnia doręczenia decyzji organu odwoławczego. W takim wypadku wstrzymanie biegu odsetek od zaległości ma na celu nieprzerzucanie na podatnika skutków opóźnień po stronie organu podatkowego. Według Mirosława Michny, dodatkową ulgę w kalkulacji odsetek od zaległości podatkowych definiuje art. 56§ 1a Ordynacji podatkowej wprowadzający obniżenie odsetek za zwłokę do 75% stawki podstawowej między innymi w sytuacji, gdy podatnik złoży, przed doręczeniem zawiadomienia o zamiarze wszczęcia kontroli, prawnie skuteczną korektę wraz z uzasadnieniem oraz w ciągu 7 dni dokona wpłaty zaległej kwoty.