Jeżeli podatnik zapłaci podatek po decyzji organu podatkowego I instancji (np. naczelnika urzędu skarbowego), a następnie upłynie termin przedawnienia tego zobowiązania, to organ II instancji (np. dyrektor izby skarbowej) ma w zasadzie nieograniczony czas na utrzymanie lub uchylenie decyzji organu I instancji. Taki wniosek można wyciągnąć z wyroku WSA w Kielcach (sygn. akt I SA/Ke 128/11).
– Oznacza to, że podatnicy, którzy spierają się z organem podatkowym o wysokość zobowiązania, ale podatek zapłacą (np. w celu uniknięcia wyższych odsetek), tracą możliwość powoływania się na przedawnienie – ocenia Grzegorz Symotiuk, specjalista w Grant Thornton Frąckowiak. W związku z tym – jak podpowiada ekspert – podatnik, który ocenia, że jego zobowiązanie podatkowe może ulec przedawnieniu, powinien wstrzymać się z zapłatą zaległości podatkowej. Zapłata podatku oznacza, że zobowiązanie podatkowe, pomimo upływu odpowiedniego terminu, nie ulegnie przedawnieniu.

Źródło: Dziennik Gazeta Prawna