Protokół o zmianie umowy dotyczy głównie tzw. klauzuli tax sparingu, która ma zastosowanie do dywidend i pozwala na odliczenie w Polsce podatku, który może być pobrany na Cyprze. Mechanizm ten jest powszechnie wykorzystywany przez polskich podatników w celu zmniejszenia wysokości podatku od otrzymywanych dywidend.

Protokół zawiera rozwiązania dostosowujące przepisy Umowy do Konwencji OECD w sprawie podatku od dochodu i majątku w odniesieniu, m.in. do stosowanych definicji, ogólnych zasad interpretacji określeń Umowy, przepisów dotyczących szacowania zysków przedsiębiorstw. Aby stworzyć korzystniejsze warunki dla rozwoju wzajemnych inwestycji protokół obniża stawkę opodatkowania odsetek u źródła z poziomu 10 proc. do poziomu 5 proc.

Zmiany dotyczące unikania podwójnego opodatkowania obejmują wprowadzenie metody odliczenia proporcjonalnego w przypadku zysków przedsiębiorstw. Protokół przewiduje, że w przypadku metody wyłączenia z progresją, Polska zwalnia dochody przypisane do zakładu, które są opodatkowane na Cyprze ale, analogicznie, nie uwzględnia ewentualnej straty poniesionej przez zakład.

Zmienione zostały również zasady opodatkowania wynagrodzeń dyrektorów spółek cypryjskich-dotychczas płacili podatki tylko na Cyprze. Ponieważ, zgodnie z prawem cypryjskim, opodatkowywani są tylko cypryjscy rezydenci podatkowi, to dyrektorzy, którzy tymi rezydentami nie są, w ogóle nie płacili podatku z tytułu otrzymywanego wynagrodzenia. Po wejściu w życie protokołu, dyrektorzy nie będący rezydentami Republiki Cypru, będą opodatkowani w kraju swojej rezydencji.

Protokół zawiera ponadto rozszerzone klauzule dotyczące wymiany informacji podatkowych, niezbędnych dla prawidłowego określania podstawy opodatkowania.

Ustawa o ratyfikacji protokołu (Dz. U. Poz. 960) wchodzi w życie 7 września 2012 roku.