Podatnik może dysponować kwotą nadpłaty, gdy brak jest zaległości i bieżących zobowiązań podatkowych.

W razie istnienia zaległości w PIT nadpłata w VAT zostanie zaliczona na tę zaległość. Jak wyjaśniają eksperci, jeżeli na podatniku ciążą zobowiązania z różnych tytułów, może on wskazać (składając wniosek), na które zobowiązanie ma zostać zaliczona nadpłata. W razie braku wniosku właściwy organ zaliczy nadpłatę na podatek o najwcześniejszym terminie płatności. Analogicznie, w razie istnienia bieżących zobowiązań podatkowych, np. zaliczek na PIT, nadpłata zostanie zaliczona na poczet tych zaliczek. Zostanie ona zaliczona z dniem powstania nadpłaty lub dniem złożenia wniosku o stwierdzenie nadpłaty. Jeśli podatnik nie wystąpi z wnioskiem o zaliczenie na przyszłe zobowiązania, nadpłata jest zwracana z urzędu. Jeśli wysokość nadpłaty nie przekracza wysokości kosztów upomnienia w postępowaniu egzekucyjnym, zostanie zwrócona uprawnionemu dopiero na jego wniosek.

źródło: Dziennik Gazeta Prawna, 10 marca 2011 r.