Głównym celem zmian w zakresie właściwości miejscowej organów celnych jest zapewnienie przez Służbę Celną profesjonalnej obsługi przejścia granicznego na terenie Portu Lotniczego Warszawa-Modlin.
Port Warszawa-Modlin znajduje się we właściwości miejscowej Naczelnika II Urzędu Celnego w Warszawie, który nie ma doświadczenia w obsłudze celnej osobowego ruchu lotniczego. W związku z powyższym wszystkie sprawy związane z obsługą ruchu lotniczego na lotniskach Warszawa-Okęcie i Warszawa-Modlin zostały przekazane Naczelnikowi III Urzędu Celnego w Warszawie.
Rozporządzenie Ministra Finansów z dnia 9 lutego 2012 r. zmieniające rozporządzenie w sprawie właściwości miejscowej organów celnych (Dz. U. Poz. 160) wchodzi w życie 15 lutego b.r.