Zmiany wprowadzone rozporządzeniem ministra finansów z 11 maja 2016 r. zmieniającym rozporządzenie w sprawie depozytu urzędu celnego (Dz. U. poz. 671) wynikają z konieczności dostosowania zawartych w obecnie obowiązującym w tym zakresie rozporządzeniu pojęć: „wspólnotowych”, „niewspólnotowych” i „Wspólnoty Europejskiej” stosowanych w WKC do odpowiednich pojęć używanych w przepisach UKC, tj. zastąpienia ich odpowiednio pojęciami: „unijnych”, „nieunijnych” i „Unii Europejskiej”. Ponadto z uwagi na fakt, iż zamówienia na druki pokwitowania przyjęcia towarów do przechowania towarów w depozycie urzędu celnego dokonywane są raz na dwa lata i obecnie ilość druków, którymi dysponują organy celne wydaje się wystarczająca na okres około 1,5 roku, wprowadzona została możliwości wykorzystania wydrukowanych już pokwitowań do końca 2017 r.
Z kolei w rozporządzeniu ministra finansów z 13 lipca 2004 r. w sprawie złożenia zabezpieczenia w formie depozytu w gotówce, we wprowadzeniu do wyliczenia sposobów złożenia zabezpieczenia w formie depozytu w gotówce art. 189 ust. 1 lub 3 WKC zastąpiono art. 89 ust. 3 UKC regulującym tę samą materię prawną. (rozporządzenie ministra finansów z 11 maja 2016 r. zmieniające rozporządzenie w sprawie sposobu złożenia zabezpieczenia w formie depozytu w gotówce (Dz.U. poz. 670).
