Równoległą nowelizację ustawy Prawo o ustroju sądów wojskowych, która reguluje status sędziów w przypadku zniesienia sądu wojskowego, planuje resort  sprawiedliwości.
Według MON zmniejszenie liczby sądów garnizonowych jest związane z koniecznością dostosowania liczby i struktur wojskowych sądów do planu zamierzeń organizacyjnych i dyslokacyjnych armii. Jest także skutkiem uchwalonej przez Sejm w grudniu ubiegłego roku nowelizacji Kodeksu postępowania karnego. Wówczas wprawdzie rozszerzono właściwości sądów wojskowych wobec spraw przeciw cywilnym pracownikom wojska, ale jednocześnie przewidziano możliwość przekazania sprawy sądowi powszechnemu w razie zwolnienia żołnierza z czynnej służby wojskowej. Zmiany te spowodowały zmniejszenie liczby prawomocnych skazań przez sądy wojskowe.
Obecnie w Polsce funkcjonują dwa wojskowe sądy okręgowe - w Warszawie i Poznaniu oraz 10 sądów garnizonowych - w Bydgoszczy, Gdyni, Krakowie, Lublinie, Olsztynie, Poznaniu, Zielonej Górze, Szczecinie, Warszawie i Wrocławiu. Projekt rozporządzenia, z którym można zapoznać się na stronie internetowej ministerstwa przewiduje, że zlikwidowane byłyby sądy w Bydgoszczy, Krakowie i Zielonej Górze. Wszczęte i niezakończone sprawy w likwidowanych sądach przekazane zostałyby do sądów  w Lublinie, Poznaniu, Warszawie i Wrocławiu. W trzech przewidzianych do likwidacji sądach garnizonowych zatrudnionych jest łącznie 12 sędziów, 23 sekretarzy sądowych i 8 innych pracowników. Według projektu noweli Prawa o ustroju sądów wojskowych, przekazanego przez resort sprawiedliwości na początku listopada do uzgodnień międzyresortowych, w przypadku zniesienia danego sądu wojskowego sędzia tego sądu na swój wniosek byłby powoływany na urząd sędziego sądu powszechnego.