Komunikat ma związek z publikacją w Dzienniku Gazeta Prawna artykułu pt. „Czynsze mogą wzrosnąć przez źle wdrożoną unijną dyrektywę", w którym zarzucono, że zwolnienie z podatku, jakie ustawa o VAT przewiduje dla spółdzielni mieszkaniowych, w związku ze świadczeniem na rzecz mieszkańców odpłatnych usług związanych z eksploatacją lokali jest niezgodne z prawem unijnym, gdyż takiej preferencji nie przewidują przepisy dyrektywy w sprawie wspólnego systemu podatku od wartości dodanej.
Zgodnie z wyjaśnieniami resortu, jeżeli spółdzielnia stosuje zwolnienie z VAT zgodnie z przepisami krajowymi, to nie może odliczać podatku naliczonego. Jeżeli spółdzielnia stosuje opodatkowanie przedmiotowych czynności, to takie działanie może powodować, że kwota czynszu będzie wyższa. Jest to spowodowane tym, że spółdzielnia decyduje się opodatkować czynność podatkiem VAT zamiast zastosować zwolnienie od podatku. Takie działanie jest podjęte na ryzyko spółdzielni i w takiej sytuacji wydaje się, że spółdzielnia powinna wyjaśnić swoim członkom dlaczego nie stosuje przepisów krajowych, zakładających zwolnienie, a powołując się na przepisy unijne, stosuje mniej korzystne dla swoich członków zasady rozliczeń.