Do końca marca 2011 r. obowiązywał art. 88 ust. 1 pkt 1 ustawy z 11 marca 2004 r. o podatku od towarów i usług (Dz. U. Nr 54, poz. 535 z późn. zm.). Przepis uchylono po tym, jak Trybunał Sprawiedliwości UE wyrokiem z 30 września 2010 r. w sprawie C-695/09, Oasis East sp. z o.o. (Dz. Urz. UE, C 317 z 20.11.2010 r.) stwierdził jego niezgodność z prawem wspólnotowym.

Podatnicy, których objął ten restrykcyjny przepis, mogą ubiegać się o zwrot nadpłaty VAT. W tym celu podatnik powinien sporządzić korekty deklaracji VAT za okresy, w których zgodnie z wyrokiem trybunału przysługiwało mu prawo do odliczenia VAT. Warunkiem odzyskania nadpłaty jest złożenie wniosku o zwrot. We wniosku należy przywołać podstawę prawną, podać wysokość nadpłaty oraz uzasadnienie. Urząd nie wypłaci nadpłaconej kwoty, jeżeli przedsiębiorca ma np. zaległości podatkowe. Oprócz nadpłaty podatnik ma również prawo do oprocentowania liczonego według stawek odsetek za zwłokę. Okres, za który należne jest oprocentowanie, zależy od tego, czy podatnik wnioskuje o zwrot nadpłaty w okresie do 30 dni od publikacji sentencji orzeczenia Trybunału Sprawiedliwości UE, czy też w okresie późniejszym. Podatnik obecnie ubiegający się o nadpłatę może wnioskować o oprocentowanie tylko od dnia jej powstania do dnia, w którym upływa 30 dni od publikacji wyroku (czyli do 20 grudnia 2010 r.). Wypłata nadpłaconego VAT ma skutki w CIT i PIT. Jeżeli niepodlegający odliczeniu VAT został przez podatników uznany za koszt uzyskania przychodów, zwrot nadpłaconego VAT wymusza korektę podatku dochodowego.

źródło: Dziennik Gazeta Prawna, 11 kwietnia 2011 r.