Przyczyny zatrzymania wadium są różne. Najczęściej chodzi o sytuacje, w których wykonawca ma obowiązek przedstawić zamawiającemu określone dokumenty jeszcze na etapie prowadzonego postępowania, a jeśli tego nie zrobi i nie wykaże, że nie mógł ich dostarczyć z przyczyn nieleżących po jego stronie, traci wadium. Czy w takim przypadku utracone wadium można zaliczyć do kosztów wykonawcy? Katowicka Izba Skarbowa twierdzi, że nie (interpretacja nr IBP-BI/1/415-750/10/RM). Uznała ona, że wykonawca nie przekazał wymaganych dokumentów na czas z własnej winy, nie dochowując należytej staranności, a zatem nie może zaliczyć wadium do kosztów prowadzonej działalności. Podobnie orzekła Izba Skarbowa w Warszawie (interpretacja nr IPPB3/423-852/10-2/GJ). Ciekawy jest fakt, że fiskus przez długi czas nie kwestionował zaliczania zatrzymanego wadium do kosztów przedsiębiorcy (np. interpretacja Drugiego Mazowieckiego Urzędu Skarbowego w Warszawie nr 1472/ROP1/423310/06/MC).
Jak podkreśla Wojciech Kaczmara, doradca podatkowy w Accreo Taxand, zatrzymane wadium to wydatek wykonawcy związany z prowadzoną działalnością gospodarczą. Zamawiający zatrzymuje wadium, ale nie ma podstawy prawnej, by wyrzucić je z kosztów wykonawcy. Inaczej jest w przetargach na zakup nieruchomości. Jeśli doszło do zawarcia umowy, należy przeanalizować, czy wadium nie stało się zadatkiem na poczet ceny.

Źródło: Rzeczpospolita z dnia 31 maja 2011 r.