„W dniu 17 sierpnia 2009 r. pełnomocnik Netii SA otrzymał informację o doręczeniu decyzji dyrektora Urzędu Kontroli Skarbowej w Warszawie, w której zostało określone zobowiązanie podatkowe Netii za rok 2003 w podatku dochodowym od osób prawnych (CIT) w wysokości 58,7 mln zł plus odsetki od zaległości podatkowych. Decyzja została wydana pomimo przedstawienia przez spółkę argumentów prawnych, z których wynikało, że ustalenia kontroli są błędne i nie mają żadnych podstaw prawnych" - głosi komunikat.

Według dyrektora UKS, nieprawidłowości w rozliczeniu za rok 2003 polegały na zaniżeniu przychodów o kwotę 303 mln zł i dotyczyły niezaliczenia do przychodów podatkowych kwot naliczonych i nieotrzymanych odsetek od pożyczek udzielonych przez Netię w latach poprzednich jej spółkom zależnym, z którymi Netia skonsolidowała się 31 grudnia 2003 r., podała spółka.
„Zdaniem Netii decyzja Dyrektora UKS stoi w sprzeczności z odpowiednimi przepisami prawa podatkowego" - napisała spółka i przedstawiła dziewięć argumentów na poparcie swojego stanowiska (m.in.: „zgodnie z przepisami ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych przychodem podatkowym są wyłącznie odsetki otrzymane, a tych Netia nie otrzymała"; „Netia nie mogłaby w żaden sposób wykazać dochodów z odsetek w roku 2003, ponieważ nawet gdyby przyjąć, że otrzymała odsetki od spółek zależnych, musiałyby być one przeznaczone na spłatę jej zobowiązań odsetkowych, a spłata przez spółkę odsetek jest jej kosztem podatkowym; otrzymane odsetki są przychodem podatkowym, a zapłacone są kosztem podatkowym").
Netia poinformowała też, że istnieje spór pomiędzy spółką a dyrektorem UKS odnośnie ustalenia czy decyzja UKS została skutecznie doręczona pełnomocnikowi spółki. Zdaniem spółki, decyzja ta nie została skutecznie doręczona.

„Z powyższych względów spółka zamierza odwołać się od decyzji wydanej przez dyrektora UKS. Decyzja dyrektora uks jako decyzja organu pierwszej instancji jest nieostateczna i niewymagalna. Spółka jest w posiadaniu opinii kilku niezależnych doradców podatkowych i prawnych, zgodnie z którymi zarzuty dyrektora uks nie mają podstaw prawnych. W związku z powyższym spółka nie zamierza utworzyć rezerwy na wysokość wskazanych w decyzji kwot zaległości podatkowych" – głosi dalej komunikat.

W I połowie 2009 roku Netia miała 14,65 mln zł skonsolidowanej straty wobec 259,29 mln zł zysku rok wcześniej przy obrotach odpowiednio 749,34 mln zł wobec 472,18 mln zł.