Spółka X realizuje sprzedaż za pośrednictwem internetu. Spółka X podpisała umowę ze spółkę Y na dokonywanie płatności w ramach systemu płatności.pl. Klienci spółki X, którzy dokonają zakupu poprzez stronę internetową będą płacić za towar za pośrednictwem Y. Po wpłynięciu pieniędzy na konto w systemie płatności, zamówienie otrzymuje status "zakończone". Spółka Y informuje o tym mailem i następnie przekazuje pieniądze na rachunek Spółki X. Po otrzymaniu potwierdzenia od spółki Y, że wpłata została dokonana, spółka X wystawi fakturę i dokona sprzedaży. Zdarzać się będą sytuacje, że wpłata nastąpi wcześniej niż powstanie faktura sprzedaży.
Czy wpłata od spółki Y jest traktowana na równi z otrzymaną zaliczką od klienta i wymaga wystawienia faktury zaliczkowej?

W sytuacji gdy przed wysłaniem towaru przez sprzedawcę otrzymują Państwo pieniądze należy uznać, że w praktyce otrzymujecie zaliczkę i należy wystawić fakturę zaliczkową. Obowiązek podatkowy w podatku VAT należy wówczas wykazać w momencie otrzymania tej kwoty.
Zgodnie z zasadą ogólną obowiązek podatkowy w podatku VAT powstaje z chwilą wydania towaru. Jeżeli natomiast dostawa towaru powinna być potwierdzoną fakturą, obowiązek podatkowy powstaje z chwilą wystawienia faktury, nie później jednak niż w 7 dniu, licząc od dnia wydania towaru. Jeżeli przed wydaniem towaru otrzymano część należności, w szczególności: przedpłatę, zaliczkę, zadatek, ratę, obowiązek podatkowy powstaje z chwilą jej otrzymania w tej części.
Jeżeli nabywca towaru wpłaca należność na poczet przyszłej dostawy, to w świetle przepisów o VAT jest to zaliczka na dostawę towaru. W takiej sytuacji cała kwota wpłaconej zaliczki powoduje powstanie obowiązku podatkowego, niezależnie od tego, kiedy zostanie zrealizowana dostawa towaru. Jeżeli zaliczka wymaga potwierdzenia fakturą VAT, to należy ją wystawić nie później niż 7 dnia, licząc od dnia, w którym otrzymano część lub całość należności (zaliczki, przedpłaty, raty, zadatku). Natomiast jeżeli wystawiona faktura na zaliczkę obejmuje całą cenę brutto towaru lub usługi, sprzedawca po wydaniu towaru nie wystawia faktury VAT. Faktura dokumentująca otrzymanie zaliczki stanowiącej 100% ceny towaru nie wymaga powtórnego potwierdzania dostawy towaru fakturą.

Dlatego też w przypadku gdy otrzymanie zapłaty wyprzedzi wydanie towaru, obowiązek podatkowy powstanie w dacie, w jakiej podatnik otrzymał pieniądze. Wynika to z konieczności opodatkowania każdej przedpłaty, zaliczki już w momencie jej otrzymania. Takie stanowisko potwierdził Naczelnik II Urzędu Skarbowego Łódź Górna w piśmie z dnia 7 kwietnia 2006 r., III-1/443-10/06/ER:
"(...) W przedstawionym przez Podatnika stanie faktycznym otrzymuje on zapłatę za wylicytowany towar po zakończeniu aukcji i dopiero wtedy dokonuje wydania towaru poprzez nadanie go w placówce pocztowej. W takiej sytuacji obowiązek podatkowy powstaje zgodnie z art. 19 ust. 11 ustawy z dnia 11 marca 2004 r. o podatku od towarów i usług (Dz. U. Nr 54, poz. 535, z późn. zm.), w momencie otrzymania tej płatności, gdyż płatność "z góry" jest bez wątpienia rodzajem zaliczki. Obowiązek podatkowy w praktyce w przypadku płatności dokonywanych np. przelewem powstaje z chwilą uznania kwoty zapłaty na rachunku Podatnika (...)".
Podobne stanowisko możemy odnaleźć w piśmie Dyrektora Izby Skarbowej w Łodzi z dnia 21 lipca 2006 r., III-1/4407int-65/VAT/06/DM, gdzie czytamy:
"(...) Jeżeli podatnik wysyła towar nabywcy obowiązek podatkowy powstaje z chwilą wydania towaru nabywcy lub wskazanej przez niego osobie, tj. powierzenie przesyłki przewoźnikowi trudniącemu się przewozem rzeczy tego rodzaju. Z kolei w przypadku, gdy płatność następuje za zaliczeniem pocztowym (pobranie) obowiązek podatkowy powstaje z chwilą otrzymania zapłaty. Natomiast w przypadku otrzymania części należności przed wydaniem towaru, obowiązek podatkowy powstaje z chwilą jej otrzymania w tej części (...)".