Przedmiotem zapytania poselskiego skierowanego do MF była dopuszczalność wydania decyzji stwierdzającej nadpłatę podatku przed zakończeniem prowadzonego równocześnie postępowania w sprawie określenia wysokości zobowiązania podatkowego.
Na gruncie przepisów Ordynacji podatkowej, postępowanie w sprawie określenia wysokości zobowiązania podatkowego i postępowanie w sprawie stwierdzenia nadpłaty stanowią dwie odrębne procedury podatkowe.
Wszczynane na wniosek podatnika postępowanie w sprawie stwierdzenia nadpłaty ma ustalić, czy podatek został pobrany w wyższej wysokości niż to wynika z przepisów. Aczkolwiek organ podatkowy może wszcząć z urzędu postępowanie podatkowe i określić prawidłową wysokość należnego podatku.
W takiej sytuacji gdy równolegle toczą się obydwa postępowania to wymiarowe uzyskuje charakter zasadniczy. Od wyniku postępowania będzie uzależniona decyzja dotycząca nadpłaty.
Resort finansów podkreślił, że w przypadku ewentualnych opóźnień w wydaniu decyzji podatnikowi przysługuje oprocentowanie nadpłaty.