W stosunku do obecnie obowiązującego wzoru wniosku PIT-16, nowy formularz zawiera zmiany dostosowujące treść wzoru wniosku do zmienionych przepisów regulujących organizację administracji podatkowej w Polsce. Zmiany te wynikają z dokonanej ustawą z 15 stycznia 2015 r. o zmianie ustawy o Służbie Celnej, ustawy o urzędach i izbach skarbowych oraz niektórych innych ustaw zmiany brzmienia art. 4 pkt 13 ustawy o zryczałtowanym podatku dochodowym od niektórych przychodów osiąganych przez osoby fizyczne, definiującej na potrzeby tej ustawy pojęcie ”urząd skarbowy”.
Zgodnie z obowiązującym od 1 kwietnia 2015 r. nowym brzmieniem tego przepisu urząd skarbowy oznacza urząd skarbowy, przy pomocy którego właściwy dla podatnika naczelnik urzędu skarbowego wykonuje swoje zadania, natomiast w poprzedniej definicji w tym przepisie pojęcia „urząd skarbowy” oznaczał urząd skarbowy, którym kieruje właściwy dla podatnika naczelnik urzędu skarbowego.
Rozporządzenie ministra finansów z 13 listopada 2015 r. w sprawie określenia wzoru wniosku o zastosowanie opodatkowania w formie karty podatkowej (Dz. U. poz. 1972) wejdzie w życie 1 stycznia 2016 r.