1 stycznia 2016 r. weszła w życie nowelizacja ustawy o PIT, która wprowadziła zmiany zasad ustalania zaliczki na podatek ze źródła przychodów – działy specjalne produkcji rolnej dla podatników ewidencjonujących zdarzenia gospodarcze w księgach rachunkowych lub w podatkowej księdze przychodów i rozchodów. W 2016 r. podatnicy ci nie składają już deklaracji PIT-6/PIT-6L. Sami ustalają wysokość zaliczki na podatek dochodowy na podstawie prowadzonych ksiąg. W związku z powyższym opracowano załącznik PIT/DS do zeznań o wysokości osiągniętego dochodu (poniesionej straty) w roku podatkowym: PIT-36 i PIT-36L, w którym podatnicy prowadzący działy specjalne produkcji rolnej i ustalający dochód na podstawie ksiąg będą podawać informacje wykazywane przed zmianą przepisów w deklaracji PIT-6/PIT-6L.
Ponadto, 1 stycznia 2016 r. weszły w życie przepisy które wprowadziły do ustawy PIT ulgę na działalność badawczo–rozwojową (ulga B+R), tj. prawo do odliczenia od podstawy opodatkowania określonej kwoty kosztów uzyskania przychodów poniesionych przez przedsiębiorcę na działalność badawczo–rozwojową (koszty kwalifikowane). W rozliczeniu podatku dochodowego za 2016 r. ulga B+R będzie odliczana w zeznaniach PIT-36 i PIT-36L. Ponadto podatnik będzie obowiązany wykazać w załączniku do tych zeznań koszty kwalifikowane podlegające odliczeniu. Resort finansów opracował więc nowe wzory formularzy PIT-36 i PIT-36L do rozliczenia podatku dochodowego za 2016 r., a także wzór nowego załącznika do tych formularzy (PIT/BR), w którym będą wykazywane koszty kwalifikowane oraz przysługująca podatnikowi wysokość odliczenia z tytułu ulgi B+R.
Wzory nowych formularzy podatkowych będą miały zastosowanie do rozliczenia podatku dochodowego od osób fizycznych za rok 2016. Jeżeli jednak przed dniem wejścia w życie rozporządzenia, zeznanie o wysokości osiągniętego dochodu (poniesionej straty), zostało złożone na formularzu dotychczasowym, uznaje się je za prawidłowe.
Rozporządzenie ministra finansów z 24 marca 2016 r. zmieniające rozporządzenie w sprawie określenia wzorów rocznego obliczenia podatku oraz zeznań podatkowych obowiązujących w zakresie podatku dochodowego od osób fizycznych (Dz. U. poz. 440) weszło w życie 2 kwietnia 2016 r.