W każdym województwie zostanie utworzony jeden urząd celno-skarbowy, którego terytorialny zasięg działania będzie obejmować teren całego województwa. Siedzibą urzędu celno-skarbowego będzie, co do zasady, miasto, które aktualnie jest siedzibą izby celnej. Jedyny wyjątek dotyczy Izby Celnej w Rzepinie, która jako jedyna w kraju nie została zlokalizowana w mieście o statusie miasta wojewódzkiego, byłego miasta wojewódzkiego (Biała Podlaska, Przemyśl, Toruń) lub na terenie dużej aglomeracji miejskiej (Gdynia). Z tego względu siedziba Lubuskiego Urzędu Celno-Skarbowego została wyznaczona w Gorzowie Wielkopolskim. Bez zmiany, w stosunku do obecnego stanu prawnego, pozostanie sieć oddziałów celnych.