Centrum powstało na bazie oddziałów zakaźnych szpitala. Projekt dotyczący realizacji tej inwestycji realizowany był od 2009 roku. Modernizacja kosztowała 37 mln zł,  czego prawie 23 mln stanowiły środki pochodzące z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego.

Podczas realizacji projektu wykonano kompleksową modernizację wszystkich oddziałów zakaźnych z wydzieleniem: odcinka izolacyjnego, izby przyjęć, działu diagnostyki obrazowej, działu diagnostyki laboratoryjnej, punktu przyjęcia materiału do dezynfekcji i sterylizacji, przychodni specjalistycznej.

Zakupiony został także niezbędny sprzęt i aparatura medyczna w tym między innymi: 64-rzędowy tomograf komputerowy, urządzenie do dializy wątroby, respiratory, kardiomonitory, łóżka do intensywnej terapii, specjalistyczny sprzęt laboratoryjny. Wszystkie zmodernizowane pomieszczenia zostały wyposażone w nowy sprzęt i meble oraz oprogramowanie komputerowe.