Od 1 września 2016 r. obowiązuje również nowela ustawy o systemie oświaty (Dz. U. poz. 1010), która likwiduje sprawdzian szóstoklasistów. Wprowadza także możliwość zakwestionowania wyników egzaminu maturalnego. Maturzyści będą mogli odwołać się także od ustalonego przez dyrektora okręgowej komisji egzaminacyjnej wyniku weryfikacji sumy punktów z części pisemnej. Sprawę rozpatrzy Kolegium Arbitrażu Egzaminacyjnego, składające się z doświadczonych egzaminatorów oraz ekspertów z danej dziedziny.
Zmiany w ustawie pociągnęły za sobą konieczność dostosowania przepisów wykonawczych. Rozporządzenie Ministra Edukacji Narodowej z dnia 31 sierpnia 2016 r. zmieniające rozporządzenie w sprawie konkursu na stanowisko dyrektora Centralnej Komisji Egzaminacyjnej i stanowisko dyrektora okręgowej komisji egzaminacyjnej (Dz. U. poz. 1384) oraz rozporządzenie Ministra Edukacji Narodowej z dnia 31 sierpnia 2016 r. zmieniające rozporządzenie w sprawie ramowego programu szkolenia kandydatów na egzaminatorów, sposobu prowadzenia ewidencji egzaminatorów oraz trybu wpisywania i skreślania egzaminatorów z ewidencji (Dz. U. poz. 1385) wykreślają przeprowadzanie sprawdzianu z wymogów stawianych egzaminatorom i kandydatowi na stanowisko dyrektora CKE.