Program uroczystości będzie bogaty. W ramach jego naukowej części przez cały rok odbędzie się kilkadziesiąt konferencji, zjazdów i sympozjów naukowych. W Krakowie obradować będą stowarzyszenia Coimbra, Europae-um, IRUN i Utrecht Network, skupiające najbardziej prestiżowe uniwersytety świata, a także krajowy KRASP. Odbędą się też posiedzenia Rady Parlamentu Studentów RP i zarządu European Students Union.

Część kulturalna obejmie m.in. koncerty muzyczne w Teatrze im. J. Słowackiego i Filharmonii Krakowskiej, plenerowy koncert dla studentów pod klubem Żaczek, liczne wystawy oraz zwiedzanie najpiękniejszych obiektów uczelni w ramach Nocy na UJ wzorowanej na Nocy Muzeów. Najważniejszy element obchodów kulturalnych to widowisko historyczno-muzyczne na Rynku Głównym, którego głównym autorem będzie artysta światowej sławy, którego nazwiska organizatorzy nie chcą zdradzać.

Patronat nad jubileuszem objął prezydent RP.